高精尖中心与北京工业大学、北京建筑大学共同培养优秀学生，开展本科生联合培养计划 “双培计划”，该项计划是由市属高校与在京央属高校共同培养优秀学生的一项重要举措。 高精尖中心能源与环境类专业每年接收生源25名，与学校教学部门密切合作，按照“1+2+1”式培养机制，由教学主管部门来统筹，高精尖中心积极参与，整体推进学生培养过程，遵守学校的管理机制。“双培计划”根据学科方向制定了培养方案，专门配辅导员老师负责学生的学习及日常生活。中心的建设与高水平人才的交叉培养有机结合，将中心的资源优势、学科优势转化成教育教学改革提升人才质量提高本科专业建设的一个重要平台和载体，高水平人才交叉培养推动了高等学校间的协同发展，创造更好的校园文化，同时培育了新的专业增长点，进一步推动学生成长成才，实现专业学科的交叉融合和优质教育资源的充分共享，增强高水平人才培养质量，更好地服务北京区域发展。

中心自2017年开始接收来自北京工业大学和北京建筑大学的双培计划学生进行为期两年的交流学习，每年学生人数在20至25之间，共计90人。学生来自能源类、环境科学、环境工程、建筑环境与能源应用工程、给排水科学与工程、能源与动力工程6个专业。学生按年级编入工学院“能源与动力工程”专业班，配备年轻教师作为班主任，每个年级配备一名辅导员。

在课程方面，开放了能源与环境系统工程专业的学科基础课、专业核心课程、专业限选课、专业任选课、以及其他本科专业的选修课共计79门供双培计划学生自由选择。并协助双培学生与校内多个学院协调选课。主要必修课程包括：《普通物理》、《基础物理实验》、《物理化学》、《计算概论》、《数值模拟》、《概率与数理统计》、《理论力学》、《材料力学》、《工程流体力学》、《环境工程学》、《环境科学》、、《能源与环境工程导论》等。在学业方面，学院和任课教师在课程结束后安排助教在课余时间为双培计划学生进行习题辅导和答疑解惑，学工办也积极协助，让双培生加入学院的课业辅导班，由学院高年级学生帮助梳理知识点和学习难点，协助双培学生更好地完成学业。另外，中心邀请北京工业大学相关领域的教员和研究生参与工程科学和新兴技术创新中心的科研工作，其教员作为访问学者加入到中心的流动科研队伍，中心协助指导其博士研究生的培养工作。